TECHNOLOGIE AFFYMETRIX


http://www.affymetrix.com/products_services/index.affx

EQUIPEMENT

TYPE DE PUCES

MARQUAGE

LOGICIEL D’ANALYSE D’IMAGE








  • 1 Four à hybridation 645

  • 2 Stations Fluidiques 450

  • 1 scanner 7000 3G avec auto-loader


TRANSCRIPTOMIQUE

  • Exon array (humain, rat, souris)

  • Gene array (humain, rat, souris)

  • 3’IVT array (humain, rat, souris et autres)


Whole transcript sense target labeling assay


3’ IVT Express kit

Expression Console

Chip-on-Chip

  • Tiling array (humain, rat, souris et autres)

  • Promoter array (humain, souris)

Hybridation seulement

Tiling analysis Software

GENOTYPAGE (Bas debit)

  • SNP 6.0 array

Cytogenetics copy number assay

Genotyping Console

microARN

  • miRNA array

FlashTag biotin RNA labeling kit (Genisphere)

miRNA QC tool



TECHNOLOGIE AGILENT



EQUIPEMENT

TYPE DE PUCES

MARQUAGE

SCANNER
(EN LIBRE ACCES)

LOGICIEL D’ANALYSE D’IMAGE



  • 1 four à hybridation


  • 12 chambres à hybridation





DNAMicroArrays


Quick Amp labeling kit
(ou autres suivant recommandations agilent)

AGILENT TECHNOLOGIES



Genepix 4000B

AXON INSTRUMENTS


Résolution 5 µm


Feature extraction

AGILENT TECHNOLOGIES


Innoscan 900

INNOPSYS


Résolution 1 µm



Remarque : Les scanners sont en libre accès

AUTRES TECHNOLOGIES



EQUIPEMENT

TYPE DE PUCES

MARQUAGE

SCANNER
(EN LIBRE ACCES)

LOGICIEL D’ANALYSE D’IMAGE



  • QArray mini GENETIX

Robot de dépôts

48 aiguilles creuses









  • Discovery VENTANA

Station d’hybridation automatisée

20 lames par run





  • Puces commerciales (humain, rat, levures et autres)


  • Puces ’home-made’ (humain, rat, levures et autres)





ChipShot direct labeling


Promega



Genepix 4000B

AXON INSTRUMENTS

Résolution 5 µm


GenePix Pro 6.0

AXON INSTRUMENTS

Genepix



Genepix 4000A

AXON INSTRUMENTS

Résolution 10 µm


Innoscan 900

INNOPSYS

Résolution 1 µm





Mapix INNOPSYS


Mapix



Remarque : Les scanners sont en libre accès

EQUIPEMENT

PROTOCOLE

LIBRE ACCES

Agilent 2100 Bioanalyzer

AGILENT TECHNOLOGIES




Contrôle qualité des ARN :

  • Mesure du rapport 28S/18S

  • Mesure du RIN (RNA Integrity Number)



Bioanalyzer


OUI

Nanodrop ND-1000 spectrophotometer

NANODROP TECHNOLOGIES


Contrôle qualité et concentration:

  • Acides nucléiques

  • Acides nucléiques marqués en fluorescence

  • Protéines

Nanodrop


OUI



EQUIPEMENT

PROTOCOLE

LIBRE ACCES

96-wells GeneAmp PCR system 9700

APPLIED BIOSYSTEMS





Gold block 96-wells GeneAmp PCR system 9700

APPLIED BIOSYSTEMS




Machines PCR

OUI



EQUIPEMENT

PROTOCOLE

LIBRE ACCES

Storm 860 phosphorimager

GE HEALTHCARE




Scanner les membranes de nylon



Storm


OUI

Hall Gilbert Durand / Bio5 - INSA
135 Avenue de Rangueil
31077 Toulouse Cedex 04
Intranet Dernière mise à jour : 17 Juin 2010