Recherche et Développement

La miniaturisation et l'automatisation des nouvelles technologies en Génomique sont les stratégies majeures de la R&D sujettes à une intense compétition internationale. Les principaux projets sont de développer des Biopuces de nouvelle génération, menés par des scientifiques dans une structure interdisciplinaire qui associe les Nano-Microtechnologies "LAAS-CNRS", la Chimie de surface "LCC-CNRS", la Biologie et la Bio-ingénierie "LBB, INSA Toulouse", et les statistiques et probabilités "LSP-CNRS, UPS Toulouse".

Nanobiotechnologies
Chimie de surface
Statistiques and Mathématiques
Bioinformatique

Nanobiotechnologies

Développement d'une nouvelle approche de détection des interactions moléculaires (ADN - ADN, ADN - ARN, ADN - protéines) basée sur la variation de conductance dans le brin d'ADN fixé entre deux nano-electrodes et développement d'un nanospotter basé sur la technologie des microleviers, dont les caractéristiques principales sont la précision nanométrique du dépôt, la maîtrise de la taille et de la forme du spot, la répétitivité et le faible coût du procédé.

Plus d'information sur le site Génopole dans le menu "Nanobiotechnologies"

Collaboration	Laboratoire d'Analyse et d'Architecture des Systèmes, Toulouse (LAAS-CNRS)
Personnes impliquées	Pr. Jean Marie François Dr Emmanuelle Trévisiol Dr Véronique Le Berre Pr. Christophe Vieu Dr Liviu Nicu Dr Childerick Severac Dr Christian Bergaud Dr. Pascal Belaubre Mike Geneviève (Ph.D LAAS) Christophe Thibault (Ph.D LAAS) Nathalie Berthet (Ph.D LBB-INSA)
Projets	Programme "Nanoprot" 2002-2005 (Proteine and Proteomique) Programme "CELBIO" 2002-2005 (Nanosciences et Nanotechnologies) Projet Européen PCRD 6 : NAPA (2003-2006) Réseau d'excellence PCRD 6 : NanotoLife (2003-2007)
Publications	L.Malaquin, C.Vieu, M.Geneviève, F.Carcenac, Y.Tauran, V.Leberre, E.Trévisiol (2004). Nanoelectrode-based devices for electrical biodetection in liquid solution. Microelectronic Engineering 73-74, 887-892. P. Belaubre, M. Guirardel,V. Leberre , J. B. Pourciel, C. Bergaud (2004). Cantilever-based microsystem for contact and non-contact deposition of picoliter biological samples Sensors & Actuators A: Physical, Issues 1-3, Vol.110, pp.130-135. Belaubre P., Guirardel M., Garcia G., Le Berre V., Dagkessamanskaia A., Trévisiol E., François J., Pourciel J.B., Bergaud C. (2003). Fabrication of biological microarrays using microcantilevers. Applied Physics Letters, 82, 3122 - 3124. F. Carcenac, L. Malaquin and C. Vieu (2002). Fabrication of multiple nano-electrodes for molecular addressing using high resolution electron beam lithography and their replication using soft imprint lithography. Microelectronic Engineering 61-62, 657.
Brevets	C. Bergaud, B. Belier, A. Martinez, L. Nicu, E. Cocheteau. Biosensor matrix and method for making same. International patent W002086479, September 23^rd, 2004 J.P. Roger, A.C. Boccara, C. Bergaud, M.C. Potier. Apparatus for parallel detection of the behaviour of mechanical micro-oscillators. International patent WO0237090, March 18^th 2004. C. Bergaud, P. Belaubre, M. Guirardel, B. Belier, J-B. Pourciel. Device for the actively-controlled and localised deposition of at least one biological solution. International patent WO03097238, November 21^st, 2003.

Chimie de surface

Développement de technologie de greffage pour les acides nucléiques, peptides et proteines, sans perte de l'activité biologique.

Collaboration	Laboratoire de chimie de coordination, Toulouse (LCC-CNRS)
Personnes impliquées	Dr. Emmanuelle Trévisiol Pr. Jean M François Dr. Jean Pierre Majoral Pr. Bernard Meunier
Publications	Le Berre, V., Trevisiol, E., Dagkessamanskaia, A., Caminade, A-M, Majoral, JP, Meunier, B. and François, J. (2003). Dendrimeric coating of glass slides for sensitive DNA microarrays analysis. Nucleic Acid Res. 31, e88, 1 - 8. Trévisiol, E., le Berre, V., Leclaire, J., Pratviel, G., Caminade, A.M., Majoral, J.P., François, J. and Meunier, B. (2003). Dendrislides, Dendrichips: a simple chemical functionalization of glass slides as an effective mean for the preparation of biochips. New J. Chem., 27, 1713 - 1719.
Brevet	Trévisiol, E., Leclaire, J., Pratviel, G., Caminade, A-M., Majoral, J.P., François, J., Meunier, B. Solid supports functionalised by phosphorus dendrimers, methods for preparing same and uses thereof. International patent WO 03/091304 A2, November 6^th, 2003.

Statistiques et Mathématiques

Développement de méthodes statistiques pour l'analyse des données d'expression des gènes.

Collaboration	Laboratoire de Probabilités et statistiques
Personnes impliquées	Pr. Jean M François Pr Philippe.Besse Dr. Serguei Sokol Pr. Alain Baccini Dr. Stephane Dejean Dr. Dominique Langin (INSERM) Dr. Nathalie Viguerie (INSERM) Dr. Magalie San Cristebal (INRA) Dr. Francois Hatey (INRA)
Site web	Analyse statistique de données transcriptomiques

Bioinformatique

Développement de logiciels bio-informatiques pour l'analyse des données d'expression.

Logiciels	"Bioplot" : Normalisation et tests statistiques de deux jeux de données d'expression, sur site web avec un accès sécurisé. Voir le manuel d'utilisation "Bioclust" : Comparaison de plusieurs jeux de données, clustering,... sur le site web avec accès sécurisé. Voir le manuel d'utilisation
Personnes impliquées	Dr. Serguei Sokol